生物信息预测方法-生物信息学预测方法

文章阐述了关于生物信息预测方法，以及生物信息学预测方法的信息，欢迎批评指正。

文章信息一览：

• 1、如何利用生物信息学研究一个蛋白分子
• 2、如何进行害虫的预测预报
• 3、急求解答:蛋白质二级结构的预测的方法?
• 4、targetscan预测结果怎么看

如何利用生物信息学研究一个蛋白分子

预测蛋白质的亚细胞定位，是通过生物信息学的方法的。 或者你在NCBI数据库中比对到了编码类似蛋白的基因，如果该基因有人做过亚细胞定位的实验，你也可以大概知道其编码的蛋白质在细胞内部的定位。不同物种，不同基因家族成员有可能有区别。

分子进化和比较基因组学，是最重要的课题之一 早期的工作主要是利用不同物种中同一种基因序列的异同来研究生物的进化，构建进化树。既可以用DNA序列也可以用其编码的氨基酸序列来做，甚至于可通过相关蛋白质的结构比对来研究分子进化。以上研究已经积累了大量的工作。

RNA测序和分析RNA测序（RNA-Seq）是一种高通量的方法，可以检测和量化细胞内所有的RNA分子，包括mRNA、miRNA和lncRNA等。生物信息学方法可以对RNA-Seq数据进行比对、拼接、注释和表达量计算等处理，以得到不同基因的表达水平和剪接异构体信息，并进一步研究其生物学功能和调控机制。

如何进行害虫的预测预报

具体的方法有：（1）历期法。根据某代或某虫态的发育历期，结合下段时间的温度等有关环境条件，推算下一代或下一虫态的发生期，以确定未来的防治适期、次数和防治方法。（2）期距法。根据害虫某虫态或虫龄发生峰日相距防治适期的天数进行预测，称为期距法。（3）物候法。

害虫发生期预测就是预测某种害虫的某一发生阶段（如害虫的某虫龄、虫态等）的出现日期，以此作为确定防治适期的依据。

玉米螟、高粱条螟的预测方法：（1）发生期预测：可利用期距法进预测，根据成虫诱测情况预报和成虫期距按虫态历期为推算卵、幼虫发生和为害的初、盛期。还可应用统计分析的方法，依据春季气温及羽化盛期、降水等因子，对发生期进行预测。

害虫蔓延的一般预测法：（1）虫源预测：多种害虫有明显的虫源中心，调查和掌握虫源地（株）的害虫动态，可作为测报其蔓延的指标。例如，蚜虫越冬虫源地集中在花椒树，春季4月当越冬寄主上出现有翅蚜，就可发出蚜虫第一次迁飞的预报。

急求解答:蛋白质二级结构的预测的方法?

1、蛋白质二级结构的研究方法有经验参数法、GOR方法。经验参数法。 经验参数法是一种基于单个氨基酸残基统计的经验预测方法。通过统计分析，获得的每个残基出现于特定二级结构构象的倾向性因子，进而利用这些倾向性因子预测蛋白质的二级结构。GOR方法。

2、Threading法。 “从头开始”（Ab initio）：只需要蛋白质序列即可进行结构预测。由于运算量大，需要有超级计算机来进行，或***用分布式计算，如Rosetta@home等。 四级结构预测：主要是预测蛋白质-蛋白质之间的相互作用方式。

3、一级结构预测 首先分析已纯化蛋白质的氨基酸残基组成。测定多肽链的氨基末端与羧基末端为何种氨基酸残基。把肽链水解为片段，分别进行分析。然后测定各肽链的氨基酸排列顺序，一般***用Edman降解法。

4、也可以是基于一些已有知识的，尝试使用已知结构数据库中的信息来预测蛋白质结构。

targetscan预测结果怎么看

1、TargetScan预测结果主要通过查看其与miRNA结合的***区域匹配程度、结合位点保守性、位点所在基因的mRNA表达水平以及预测得到的生物学功能等来判断。首先，我们要关注TargetScan预测结果中的***区域匹配程度。***区域是miRNA与mRNA结合的关键部位，其匹配程度直接影响了miRNA对目标mRNA的调控效果。

2、只是找交集的话excel就可以吧：先对靶基因排序，然后执行函数“=if（A1=A2，same，）”就可以看到哪些基因被多次预测。 R语言里的Venn package则可以快速计各个结果相互之间的overlap情况。 不过，pictar预测出来的是NM编号的转录本，而非基因名； 而targetscan和miRanda预测出来的是基因名。

3、你都没看什么文献吧。miRNA一般与靶基因的3UTR区结合。当匹配紧密的时候，miRNA与RISC形成沉默复合物，降解mRNA。匹配不完全的时候，起到的是翻译抑制的作用。植物体内miRNA的主要是通过降解mRNA来实现的。而动物体内是mRNA的作用是翻译抑制。

4、有很多生物软件可以预测某个miRNA的靶基因，如TargetScan，mirBase，PicTar，结合miRNA芯片筛选。

关于生物信息预测方法，以及生物信息学预测方法的相关信息分享结束，感谢你的耐心阅读，希望对你有所帮助。