生物信息软件汇总-生物信息学相关软件

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文章信息一览：

• 1、高分求助:常用生物统计学软件介绍及相互区别?需要详细一点
• 2、生物信息学常用的软件有哪些?
• 3、生物信息学一些基本的常用软件有哪些

高分求助:常用生物统计学软件介绍及相互区别?需要详细一点

1、学统计的同学最合适生物统计学专业。其次是数学尤其是应用数学出身的。如果有学计算机专业的同学对此感兴趣，也是可以的，特别是研究data mining 的。尽管这个专业以bio开头，其实需要的生物内容是很少的，即使是要求高的学校，研究生上几门 molecular biology之类的入门课程就可以了。

2、生物信息是数学，生物知识与计算机软件结合的交叉学科（注意学科顺序），生物信息侧重于算法研究，用于研究解释各种组学（基因，蛋白，转录组学等）数据的变化特征，其学科特点还是做基础研究，多挖掘出点新东西，即使这些新东西没经过验证。

3、农业与生物学研究中，不论农作物还是微生物，其生长、发育以及最终所表现的产量受多种因素的影响，其中有些属自然的因素，如光、温、湿、气、土、病、虫等，有些是属于栽培条件的，如肥料、水分、生长素、农药、除草剂等。

生物信息学常用的软件有哪些?

1、TRF ：是基因组注释中常用于检测序列中串联重复序列的软件。 cafe ：基因家族收缩和扩张。 GMATA ：分析基因组中的SSR序列（SSR：微卫星序列，串联重复） RepeatMasker ：鉴别转座子（TE）屏蔽转座子（TE）。

2、一般来说所用的分析工具有在线跟下载的 下面简要列举一些常用在线软件的使用 使用VecScreen工具，分析下列未知序列，输出序列长度、载体序列的区域、可能使用的克隆载体都有哪些。步骤：打开google 首页，搜索VecScreen，进入VecScreen首页，***序列，运行，View report。

3、最常用的东西：1，你需要会用Linux，会使用bash2，高于入门级的统计学知识，以及一门统计语言，比如R3，至少一门编程语言，一般来讲C++，Perl，Python，Java这几种中的一种。4，对于你工作的领域，需要懂这方面的生物学知识，也需要知道目前人们在这个领域里都用什么其他软件。以上四点我觉得必不可少。

4、建立基础知识：先学习生物学、计算机科学和统计学的基础知识，掌握常用的生物学术语和基本的编程概念。可以参考一些经典教材如《生物信息学导论》、《R语言实战》等。

5、数据，网上现在的数据库很多，最常用的是NCBI，TCGA，千人基因组等，要是想找特定的数据，有tRNA数据库，PDB，NDB等，每个数据库的侧重点都不相同，但是以NCBI最全面，最准确。

6、前言： nanopolish是开源的综合性分析软件，集成了非常多的三代测序数据分析小工具。

生物信息学一些基本的常用软件有哪些

1、以下是一些常见的生物信息学应用程序，可以在个人电脑上运行： 基本序列分析软件：包括NCBI BLAST、EMBOSS、CLC Sequence Viewer等。这些软件主要用于序列比对、互补序列搜索和序列编辑等基本分析。 DNA测序数据分析软件：包括FastQC、Trimmomatic、BWA等。

2、AUGUSTUS ：是真核基因组结构从头预测软件，主要运用广义隐马尔可夫的概率模型（GHMM）进行基因结构的预测。通过分析DNA序列在概率模型中最有可能的基因结构，从而发现目标DNA序列中的基因。

3、最常用的东西：1，你需要会用Linux，会使用bash2，高于入门级的统计学知识，以及一门统计语言，比如R3，至少一门编程语言，一般来讲C++，Perl，Python，Java这几种中的一种。4，对于你工作的领域，需要懂这方面的生物学知识，也需要知道目前人们在这个领域里都用什么其他软件。以上四点我觉得必不可少。

关于生物信息软件汇总，以及生物信息学相关软件的相关信息分享结束，感谢你的耐心阅读，希望对你有所帮助。