修饰蛋白质组定量分析-蛋白质修饰的研究方法

文章信息一览：

• 1、技术|一文读懂蛋白质组学
• 2、组蛋白修饰的作用?组蛋白修饰酶有哪些?
• 3、蛋白质组学的研究策略是什么
• 4、关于蛋白质组学检测结果分析求助

技术|一文读懂蛋白质组学

1、蛋白质组学的应用如个性化医疗和生物标志物发现，展示了其广阔前景（跨领域应用，推动医疗科技的革新）。

2、质谱技术，如ESI-MS/MS和MALDI-TOF-MS，发展迅猛，它们不仅具有高灵敏度，还具备快速多用途的特点。定量蛋白质组学方法如SILAC、ICAT和iTRAQ各有所长，其中iTRAQ凭借其广泛的应用，但其可重现性和动态范围仍有提升空间。

3、蛋白质结构分析：包括X射线晶体学、核磁共振（NMR）和电子显微镜（EM）等技术，用于解析蛋白质的三维结构，从而理解其功能和相互作用机制。这些技术的选择取决于研究目的、样品类型和可用设备等因素。

组蛋白修饰的作用?组蛋白修饰酶有哪些?

1、组蛋白修饰在转录调控中起着重要的作用。它们可以通过改变染色质的结构来调节基因的表达。以下是组蛋白修饰在转录调控中的几个重要作用方式：染色质的松弛和紧缩：乙酰化和去乙酰化修饰可以调节染色质的结构。乙酰化使得组蛋白更为松弛，使其易于转录因子和RNA聚合酶的结合，从而促进基因的转录。

2、主要有甲基化，乙酰化，磷酸化等。一般甲基化与染色体的失活有关。乙酰化一般代表染色质的活性状态，有的组蛋白要先去甲基化，再乙酰化活化。磷酸化（如H1的）一般与细胞周期的状态有关，不能磷酸化，染色体不能进行。

3、分子效应：乙酰化可能通过对组蛋白电荷以及相互作用蛋白的影响，增加组蛋白与DNA的排斥力，来调节基因转录。

蛋白质组学的研究策略是什么

蛋白质组学的研究内容包括：蛋白质鉴定：可以利用一维电泳和二维电泳并结合Westemn等技术，利用蛋白质芯片和抗体芯片及免疫共沉淀等技术对蛋白质进行鉴定研究。翻译后修饰：很多mRNA表达产生的蛋白质要经历翻译后修饰如湖化，糖基化，酶原激活等。

蛋白质组学的研究方法有蛋白质鉴定、翻译后修饰、蛋白质功能确定、蛋白质靶向定量技术。蛋白质鉴定：可以利用一维电泳和二维电泳并结合Western等技术，利用蛋白质芯片和抗体芯片及免疫共沉淀等技术对蛋白质进行鉴定研究。

双向电泳（two-dimensional electrophoresis， 2-DE）与质谱（mass spectrum， MS）的结合是最常见的蛋白质组学的研究手段。双向电泳包括第一向等电聚焦（Isoelectric focusing， IEF）和第二向SDS-PAGE（sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis）。

双向电泳技术（理想目的：将细胞（或组织）内所有蛋白质都分离开来）质谱技术及一系列派生技术 （测蛋白质序列）3 、蛋白质互相作用研究：酵母双杂交，细菌双杂交，免疫共沉淀技术，pull-down，FRET，BiFC等 蛋白质定位：荧光标记技术，共聚焦荧光显微镜技术，免疫荧光，免疫化学等技术。

蛋白质样品中的不同类型的蛋白质可以通过二维电泳进行分离。胶染色后可以利用凝胶图象分析系统成像，然后通过分析软件对蛋白质点进行定量分析，并且对感兴趣的蛋白质点进行定位。

此外，通过表达载体进行蛋白质的体外扩增和纯化也并非易事，从而难以制备大量的蛋白质。蛋白质组学的兴起对技术有了新的需求和挑战。蛋白质组的研究实质上是在细胞水平上对蛋白质进行大规模的平行分离和分析，往往要同时处理成千上万种蛋白质。

关于蛋白质组学检测结果分析求助

1、利用如STRING、BioGRID等数据库，构建蛋白质之间的相互作用网络。（2）识别关键蛋白或亚网络，它们可能在疾病或特定生物过程中起到中心作用。验证：使用西方印迹、免疫荧光等技术，对筛选出的关键差异蛋白进行实验验证。

2、蛋白质鉴定：可以利用一维电泳和二维电泳并结合Western等技术，利用蛋白质芯片和抗体芯片及免疫共沉淀等技术对蛋白质进行鉴定研究。翻译后修饰：很多mRNA表达产生的蛋白质要经历翻译后修饰如磷酸化，糖基化，酶原激活等。

3、蛋白质是组成人体一切细胞、组织的重要成分。机体所有重要的组成部分都需要有蛋白质的参与。一般说，蛋白质约占人体全部质量的18%，最重要的还是其与生命现象有关。[1-2]蛋白质（protein）是生命的物质基础，是有机大分子，是构成细胞的基本有机物，是生命活动的主要承担者。没有蛋白质就没有生命。

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