蛋白质组学prm验证-蛋白质组学的一般流程

蛋白质工程 42

今天给大家分享蛋白质组学prm验证,其中也会对蛋白质组学的一般流程的内容是什么进行解释。

文章信息一览:

TMT定量蛋白组学助力PRV-宿主细胞互作的分子机制研究

迄今为止,应用蛋白质组学来分析PRV-宿主细胞互作机制的研究还很少。因此本文***用TMT标记定量蛋白质组学方法来比较PRV感染后宿主细胞的蛋白表达差异,为进一步揭示PRV发病机制和潜在的抗病毒靶点提供理论依据。

我们可以重新提取一次,先排除是否是提取造成的差异;如果是样品本身的差异,建议用label free的方法,每个样品单独做定量,而不要用iTRAQ或TMT标记定量,否则会因为中间这个高丰度蛋白的影响,而导致定量不准。 我们再看来几种常见的问题,以及解决方法,如下图: 情况1:提取出来的结果差异很大。

蛋白质组学prm验证-蛋白质组学的一般流程
(图片来源网络,侵删)

单细胞测序发现细胞类型特异性 最后,作者使用背外侧前额叶皮层样本(dPFC)单细胞RNA测序数据进行分析,发现在先前确定的11个重要风险基因中,有6个基因呈现细胞类型特异性富集。

总结目前科研现状,癌症蛋白质组学的研究方向主要有寻找风险预测、癌症分级和预后的标志物、确认有效的治疗靶点和翻译后修饰如磷酸化、乙酰化、糖基化等。此外,肿瘤异质性问题对单细胞水平的蛋白质研究提出了要求。

代谢组学着重研究的是生物整体、器官或组织的内源性代谢物质的代谢途径及其所受内在或者外在因素的影响及随时间变化的规律。代谢组学通过揭示内在和外在因素影响下代谢整体的变化轨迹来反映某种病理生理过程中所发生的一系列生物事件。

蛋白质组学prm验证-蛋白质组学的一般流程
(图片来源网络,侵删)

蛋白质组的经典研究路线

蛋白质样品的制备:蛋白质样品的制备是蛋白质组学研究的首要环节,也是最为重要的部分。蛋白质样品的质量直接影响到科学研究的真实性和可信度。

蛋白质组学的研究方法有蛋白质鉴定、翻译后修饰、蛋白质功能确定、蛋白质靶向定量技术。蛋白质鉴定:可以利用一维电泳和二维电泳并结合Western等技术,利用蛋白质芯片和抗体芯片及免疫共沉淀等技术对蛋白质进行鉴定研究。

蛋白质相互作用的研究,酵母双杂交和噬菌体展示技术无疑是很好的研究方法。LCM-二维电泳-质谱的技术路线是典型的一条蛋白质组学研究的技术路线,除此以外,LCM-抗体芯片也是一条重要的蛋白质组学研究的技术路线。

关于蛋白质组学prm验证和蛋白质组学的一般流程的介绍到此就结束了,感谢你花时间阅读本站内容,更多关于蛋白质组学的一般流程、蛋白质组学prm验证的信息别忘了在本站搜索。

扫码二维码