生物信息学数据库的文章-生物信息学常用数据库及工具

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文章信息一览：

• 1、求一篇2000字左右的论文:生物信息在生物学研究中的作用
• 2、基于序列的miRNA靶基因预测
• 3、7+:新的关键基因筛选思路

求一篇2000字左右的论文:生物信息在生物学研究中的作用

1、生物信息在生物学研究中的作用。生物信息是指生物体中包含的全部信息，如基因组信息、蛋白质、核酸、糖类等生物大分子的结构等。生物信息对生物体的生存、繁殖都起着重要作用。

2、生物科技论文2000字范文篇一：《谈谈生物高科技的发展》 摘要：生物技术的主要作用是通过农业和医药的进步，提高我国人民的健康保障。生物技术有着诱人的前景，是我国经济发展的希望所寄，它不仅能成为重要的生财之道，而且可能成为二十一世纪的经济支柱，对人类做出重大贡献。

3、生物信息在生物学研究上的应用主要包括在基因组学研究上的应用和在蛋白质组学研究中的应用。在基因组学研究中的应用 基因组（genome）表示一个生物体所有的遗传信息的总和。一个生物体基因所包含的信息决定了该生物体的生长发育、繁殖和消亡等所有生命现象。

4、唐治容 摘要：生物学的重要性日益突显，它与生活、农业、环保与技术等有密切的联系。关键词：生物学 知识 重要性 二十一世纪是生物的世纪，为什么这么说呢？这是因为在今天，生物学的重要性日益彰显。生物学是一门基础自然学科，研究生命现象和生命活动规律。人们的生活处处都离不开生物。

5、关于生物的科技论文范文篇一 如何学好高中生物 生物学是 自然 科学中的一门基础学科，学科的特点不仅具有理论的严密性，同时更具有应用的广泛性。高中生物更侧重于生物科学理论的学习和其应用方面，它研究的内容包括生物的结构，生理，分布，遗传和变异，进化，生态及稳态等。

基于序列的miRNA靶基因预测

1、基于序列的miRNA靶基因预测是生物信息学领域的一个重要研究方向。在微信公众号的文章中，我们曾零星介绍了多个与miRNA相关的数据库和工具，例如miRBase、miRTarBase、miRcode、starbase（ENCORI）以及Targetscan等。

2、首先，基于序列匹配的方法通过比较miRNA序列与靶基因3非翻译区（3 UTR）序列，寻找互补配对的miRNA靶位点。常用工具如TargetScan、miRanda、PicTar等。其次，基于保守性的方法利用跨物种基因组序列比对，预测miRNA靶位点上的保守序列区域，识别可能的靶基因。PhyloP、PhastCons等工具适合进行此类保守性分析。

3、miRWalk0数据库是预测miRNA靶基因的重要工具。此数据库提供最全面的miRNA与mRNA相互作用预测与实验验证，极大地帮助研究者研究miRNA。它记录了基因完整序列中的miRNA结合位点，并与12个现有数据库结合，包括基于promoter、cds、5’-和3’-UTR的数据。

4、TargetScan是一款广受认可的miRNA靶基因预测工具，其预测原理基于多个关键点。首先，TargetScan基于miRNA和mRNA之间的结合模式进行预测。它利用RNA二级结构分析，寻找miRNA与mRNA 3’UTR区域可能结合的区域。其次，预测依据包括保守的***区域匹配和互补性评估。***区域是miRNA的关键部分，与mRNA结合时起主要作用。

7+:新的关键基因筛选思路

数据集来源：整合了GSE10334和GSE16134两组数据。 差异基因筛选：应用limma包进行差异表达分析，识别出表达水平在log2 5倍以上且P值低于0.05的牙周炎差异表达基因。

接着，利用WGCNA筛选关键模块，构建共表达网络，确定了180个基因的antiquewhite4模块和7个关键模块，为候选诊断基因提供了基础。通过分析共享基因签名，12个基因（如CHST1GLIPR1等）与PCOS和RIF的发病机制相关。

USP7通过促进Axin稳定性来抑制Wnt/β-catenin信号传导的研究揭示了一个关键机制。这项由诺华制药生物医学研究所发表的研究发现，USP7作为一种负调控蛋白，其功能依赖于其去泛素化酶活性。USP7通过与Axin的TRAF结构域相互作用，防止Axin过度降解，从而影响β-catenin信号传导。

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