tags生物信息-生物信息geo

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文章信息一览：

• 1、EST序列表达序列标签
• 2、DNA数据库UniGene
• 3、EST分子标记标记的原理

EST序列表达序列标签

EST是Expressed Sequence Tag的缩写，意思是表达序列标签，指从一个随机选择的cDNA 克隆，进行5’端和3’端单一次测序挑选出来获得的短的cDNA 部分序列。

生物信息学方法的引入，特别是对于表达序列标签（ESTs）的序列延伸，具有巨大的潜力。通过这种方法，我们可以获得基因片段甚至全长cDNA，极大地推动了基因克隆和表达分析的进程，为科研工作注入新的活力。同时，这也为生物信息学功能的全面发挥提供了丰富的应用领域，为基因研究带来了前所未有的机遇。

在构建基因组物理图谱的过程中，ESTs（Expressed Sequence Tags，表达序列标签）扮演着不可或缺的角色。ESTs通过发展出的PCR或杂交分析技术，帮助识别基因组中如YACs（ yeast artificial chromosome，酵母人工染色体）和BACs（bacterial artificial chromosome，细菌人工染色体）等大型插入克隆载体。

DNA数据库UniGene

1、UniGene项目的目标是通过从GeneBank中精心筛选，提取出那些去除无关部分、直接针对基因的序列串，以此构建转录图谱。这个数据库汇集了来自多种生物的基因信息，每个序列串都与特定的基因及其详细资料相关联，如基因在哪些生物组织中活跃，以及在图谱中的具***置等。

2、GeneBank一般指GenBank。GenBank是美国国家生物技术信息中心（National Center for Biotechnology Information，NCBI）建立的DNA序列数据库，从公共资源中获取序列数据，主要是科研人员直接提供或来源于大规模基因组测序***（Benson等，1998）。GenBank属于一个序列数据库的国际合作组织，包括EMBL和DDBJ。

3、GenBank是国际上几个主要序列数据库组织之一，其他成员包括欧洲分子生物学实验室（EMBL）和日本DNA数据库（DDBJ）。它是美国国立卫生研究院（NIH）的遗传序列数据库，包含了经过注释的、可以公开获取的DNA序列***。

EST分子标记标记的原理

1、EST（ExpressedSequenceTag）分子标记技术是一种用于识别和标记基因表达的分子标记技术。首先，从感兴趣的组织或细胞中提取总RNA，总RNA包含了细胞内的所有转录本。接着，使用逆转录酶（reversetranscriptase）和随机引物，将RNA转录成相应的互补DNA（cDNA），这一步将mRNA转录本转化为其互补的单链cDNA。

2、EST是Expressed Sequence Tag的缩写，意思是表达序列标签，指从一个随机选择的cDNA 克隆，进行5’端和3’端单一次测序挑选出来获得的短的cDNA 部分序列。

3、EST-SSR分子标记是通过表达序列标签开发的微卫星标记，相比于基因组SSR，它在不同植物物种之间具有较高的转移性。近年来，EST-SSR在植物基因组学研究中扮演了重要角色，包括遗传图谱构建、比较作图、遗传多样性评价、种质鉴定、系统发育与进化研究等。

4、首先，它们被用来构建基因组的遗传图谱和物理图谱，为基因定位和克隆提供线索。其次，作为探针在放射性杂交技术中起着关键作用。此外，EST还是发现新基因的有效手段，可以作为分子标记来研究生物群体的多态性。总的来说，EST是生物科学研究中不可或缺的工具，为我们理解基因表达和生物学多样性提供了重要信息。

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