下载蛋白质pdb-蛋白质的pdbid在哪里找

本篇文章给大家分享下载蛋白质pdb，以及蛋白质的pdbid在哪里找对应的知识点，希望对各位有所帮助。

文章信息一览：

• 1、蛋白质数据库是什么网站
• 2、怎样获得化合物的三维结构图,.PDB格式的?
• 3、同源建模预测蛋白质三维结构(SWISS-MODEL+Pymol零基础教程)

蛋白质数据库是什么网站

蛋白质数据库（Protein Data Bank， PDB）是一个生物大分子，如蛋白质和核酸，的数据库。这些数据包括X光晶体衍射或者NMR核磁共振显示以及由全世界生物学家和生物化学家上传，在网上，它们可以通过PBD的会员组织（PDBe， PDBj， RCSB）免费获取。

蛋白质数据库（Protein Data Bank， PDB）是收集和存储生物大分子，如蛋白质和核酸结构数据的重要平台。这些数据来源于全球范围内的生物学家和生物化学家的研究成果，通过X光晶体衍射或NMR核磁共振技术获取。PDB的数据可通过PDBe， PDBj， RCSB这三个会员组织免费访问。

蛋白质数据库（Protein Data Bank， PDB）是一个包含由全球生物学家和生物化学家上传的蛋白质或核酸的X光晶体衍射或NMR核磁共振结构数据的生物大分子数据库。内容主要由世界蛋白质数据库（Worldwide Protein Data Bank， wwpdb）管理，可通过PDB的会员组织如PDBe、PDBj、RCSB免费获取。

网址： pimp.starflr.info/ 简介：提供蛋白质突变数据库，通过蛋白质质谱图的改变，检测与疾病相关的突变。Sys-BodyFluid 网址： biosino.org/bodyfluid/ 简介：提供人体各种体液的蛋白质组数据。BloodExpress 网址： hscl.cimr.cam.ac.uk/blo...简介：提供小鼠造血过程基因表达数据。

网址：proteinatlas.org 数据：The Human Protein Atlas（人类蛋白质图谱数据库），基于蛋白组学、转录组学以及系统生物学数据，可以绘制蛋白质图谱的数据库。

怎样获得化合物的三维结构图,.PDB格式的?

1、要看PDB结构当然是去Protein Data Bank主页，所有的蛋白质结构都存放在PDB里面，每一个结构都有一个编号。

2、ICSD无机晶体结构数据库：世界最大的无机晶体结构数据库，包含近30万个晶体结构数据。ICSD专注于无机化合物，提供详细的晶体结构信息，如化学名、化学式、单位晶胞、空间群等。数据可追溯至1913年，每年新增约12000种新化合物。

3、晶体反向检索：摩熵化学 支持通过晶体信息查询化合物，输入任意晶体结构信息（化学式、DOI、空间群、晶胞体积、a/nm、α/°、b/nm、β/°、c/nm、γ/° ）就能匹配相关化合物。这一功能特别有助于解析复杂的化学结构，使得研究者能够更加轻松地进行化合物的鉴定和结构解析。

同源建模预测蛋白质三维结构(SWISS-MODEL+Pymol零基础教程)

在同源建模预测蛋白质三维结构（SWISS-MODEL与Pymol的零基础教程）中，我们首先通过在线Swiss-model预测目标蛋白的***结构，下载pdb文件，并从PDB数据库中找到同源蛋白结构。接着，使用Pymol软件处理pdb文件，通过设置颜色和标签，突出显示活性位点。

SWISS-MODEL网站地址： https：// 是一款用同源建模法预测蛋白质***结构的全自动在线软件。

1 ）比较建模法（ comparative modeling method ） 比较建模法是基于知识的蛋白质结构预测方法，又称为同源结构预测，是根据大量已知的蛋白质三维结构来预测序列已知而结构未知的蛋白质结构。

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