生物信息快速入门-生物信息怎么入门
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一篇2区的基因家族分析文章带你飞
Motif分析和系统发育分析 为了阐明BZR家族的进化关系,作者基于来自甜菜、拟南芥、水稻和大***的41个BZR家族成员的氨基酸序列构建了系统发育树,并进行了motif分析。 BvBZR 基因染色体分布和基因结构分析 作者将鉴定的6个 BvBZR 基因定位到了甜菜基因组的5条染色体上,并对基因结构进行了分析。
通过解析家族组成、分类和演化历程,科学家得以揭示植物形态发育与进化之间的微妙联系,这在理解植物生命历程中具有里程碑意义。解锁功能之锁:每个家族成员都扮演着独特的角色,从生长发育到环境适应。
WRKY 基因家族是植物前十大蛋白质家族之一,大量研究表明, WRKY 基因家族的许多成员参与调控植物的生长发育、形态建成与抗病虫等。在这些常规的生信分析后,一般的文章还会加上一些湿实验去验证,例如不同非生物条件下基因家族的表达等(PCR为主)。
OrthoFinder的分析过程分为如下几步: BLAST all-vs-all搜索。使用BLASTP以evalue=10e-3进行搜索,寻找潜在的同源基因。(除了BLAST, 还可以选择DIAMOND和MMSeq2) 基于基因长度和系统发育距离对BLAST bit得分进行标准化。
主要实验结果如下:OsMKK染色体定位、进化树和基因结构分析表明,OsMKK基因家族的8成员位于4条不同染色体上,分为2大类,A、B、C、D4个亚组。第一大类有3个基因:OsMKKOsMKKOsMKK3,含有多个内含子和外显子,其调控形式多样。
NCBI上有的基因组代表是已经报道过了?
1、是。基因组数据在日常科研中具有非常重要的作用,几乎***都会用到。基因组数据一般都会被收录到某些数据库,当然也有些物种是独立的网址数据库。NCBI全称国家生物技术信息中心是隶属美国国家卫生研究所的国家医学图书馆(NLM)的分部。NCBI拥有包括大约40个在线文献和分子生物学数据库。
2、查询基因组数据库。目前全球有多个基因组数据库,比如NCBI、Ensembl、UCSC、DDBJ等。在这些数据库中,可以查询到已经发布的各种物种的基因组信息,如果某种动物的基因组已经被测序过并且被发布到数据库中,就可以在这些数据库中找到相关信息。
3、NC表示人类基因组DNA的RefSeq。(链接序列)NM表示mRNA的RefSeq。
4、目前已完成全基因组测序的物种主要可以分类三大类,模式物种、农作物和经济作物、有药用价值的物种。
5、NG_***:genomic mixed,不完整的基因组区域,提供NCBI基因组注释途径。
今日科普:关于动物克隆的三大入门级问题!
1、克隆的定义与生物奥秘克隆,源自希腊语,即英文clone或cloning的音译,本质上是无性繁殖的一种形式,自然界的扦插和嫁接就是常见的例子。而在动物界,它是指通过生物技术,从一个体细胞***出与原个体基因完全相同的后代,这一过程被称为动物克隆。
2、回答第一问:多利用的克隆细胞是一个成年羊的乳腺细胞的细胞核和一个卵细胞的细胞质。用乳腺细胞的细胞核是要证明已经分化的动物细胞细胞核同样具有细胞全能性。就是分化细胞的细胞核同样含有全套基因组,同样可以发育成有机体。
3、克隆技术可以用来生产“克隆人”,可以用来“***”人,因而引起了全世界的广泛关注。对人类来说,克隆技术是悲是喜,是祸是福?唯物辩证法认为,世界上的任何事物都是矛盾的统一体,都是一分为二的。克隆技术也是这样。
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