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文章信息一览：

• 1、生物信息流程搭建方法
• 2、网上的生物信息学资源都有哪些
• 3、哪个机构的官网上集成了生物医学领域的基因库
• 4、生信分析是什么意思
• 5、我进行生物信息学分析,请问,用什么好

生物信息流程搭建方法

1、用法可参考博文： https：//wenlongshen.github.io/2018/09/15/Pipelining-Solution-2/ docker不是一个流程方法，只是个封装的容器工具而已，所以这个分类比较牵强，只是上面两种的延伸。我们把自己开发的流程做成Docker镜像，以便使用和分享。以ChIP-seq等分析时常用的peak calling工具MACS2为例。

2、将看到 splitLetters 实际上跳过了流程的执行（流程ID相同），并且从缓存中检索了其结果。第二个过程按预期执行，打印反转的字符串。管道参数可以通过在变量名前添加前缀 params （用点字符分隔）来简单声明。

3、Disco（Python），Skynet（Ruby）。本质上，MapReduce框架把任务分解为离散的“亚任务”（Map步骤），分布在网络计算节点上，然后把单独“亚任务”的结果聚集起来（Reduce步骤）。

网上的生物信息学资源都有哪些

丁香园（生信板块）：国内知名论坛，医学生必去之地。小木虫：资源丰富，国内另一个重量级论坛。生物统计家园：有待你探索的统计领域宝藏。基因堂：聚焦基因科学，扩展你的知识视野。biostars：问题与答案的交流平台，提升实战能力。实战与工具篇：ROSALIND：实战训练的天堂，提升英语与技能两不误。

http：//沈梦圆博客/——沈师姐的宏基因组研究博客，独特且专业，github上的资源值得一探。http：//shemy.site/鸣一道/——专注于R语言作图的博客，虽然目前无法访问，但曾经的精彩内容不容错过。PLOB/——生物信息学知识库，汇集了基础到专业的资料，是学习者的知识宝库。

有很多，你要是做生物信息学需要三个方面的资源 1，数据，网上现在的数据库很多，最常用的是NCBI，TCGA，千人基因组等，要是想找特定的数据，有tRNA数据库，PDB，NDB等，每个数据库的侧重点都不相同，但是以NCBI最全面，最准确。

Uniprot：全蛋白库。NCBI和EBI的蛋白库来源于此。目前包括两部分：SwissProt是人工校对过的，TrEMBL是自动校对的。Pfam：蛋白家族库。可以使用配套的HMMER进行搜索。比BLAST能找到更远缘的东西，而且找到的东西是结构域。Rfam：RNA的，类似Pfam。RDP：16S rRNA库。

下面将分别介绍这三个最大的数据库以及其他的生物信息学数据资源。1．NCBI简介 NCBI-Genome Database：存储了目前绝大多数的被测序出来的基因组，目前有1000+基因组被测序出来。NCBI-Nucleotide/protein （RefSeq）：将不同的版本作了整合之后的参考序列。其中NM_*表示核酸序列，NP_*表示蛋白序列。

生物信息学的数据库的类型有基因组数据库、蛋白质数据库、代谢组数据库、基因调控数据库、生物样本数据库，具体特点如下：基因组数据库：这些数据库存储了各种生物体的基因组序列信息，包括DNA序列、RNA序列和蛋白质序列等。

哪个机构的***上集成了生物医学领域的基因库

美国国立生物技术信息中心：美国国立生物技术信息中心，位于马里兰州的贝塞斯达，参议员ClaudePepper意识到信息计算机化过程方法对指导生物医学研究的重要性，发起了在1988年11月4日建立国立生物技术信息中心的立法。

综合性检索系统：中国知网（CNKI）、万方数据、维普资源、国家图书文献中心（NSTL）、中国高等教育文献保障系统（CALIS）、中国科学引文数据库（CSCD）。（2）专业性检索系统：中国生物医学文献服务系统（SinoMed）、万方医学网、中国疾病知识总库。

搜索PubMed的***，在***内就可以看到相关机构名称。PubMed是一个免费的搜寻引擎，提供生物医学方面的论文搜寻以及摘要的资料库。它的资料库来源为MEDLINE。其核心主题为医学，但亦包括其他与医学相关的领域，像是护理学或者其他健康学科。

NIH是National Institutes of Health的缩写，翻译成中文就是国家卫生研究院。NIH是美国***负责生物医学研究和医学教育的机构，主要目的是保障国民的健康和预防疾病的发生。NIH是全球著名的生物医学研究机构之一，自20世纪以来一直在世界范围内推动生物医学领域的发展。

图1 位于深圳市大鹏新区的国家基因库一期项目 “干”“湿”“活”三位一体 在我国建立基因库之前，美国、欧洲和日本就已经建立了大型基因数据库，而且这三大库里的生物信息数据几乎涵盖所有已知的脱氧核糖核酸、核糖核酸和蛋白质数据。

生信分析是什么意思

生信分析，意思如下：生信分析是生物信息分析的意思。生物信息是反映生物运动状态和方式的信息。遗传密码便是生物信息。自然界经过漫长时期的演变，产生了生物，逐渐形成了复杂的生物世界。生物信息分析师是具备生物学，计算机以及统计学知识，从事基因相关数据分析的专业人员。

生信分析是指生物信息分析、方法和技术对生命科学数据进行分析和研究的一个领域。生信分析主要应用于分子生物学领域，是对大量生物信息数据进行有效处理、挖掘和分析的重要手段。

生信分析主要包括两大类：一类是对DNA、RNA、蛋白质和代谢物进行定量和定性分析；另一类是对复杂的生物信息数据进行图形化展示、可视化分析以及机器学习方面的应用。

生信分析（Bioinformatics Analysis）：生信分析是应用计算机科学、统计学和生物学知识来处理、分析和解释生物学数据的过程。它包括了对不同类型的生物学数据，如基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学数据的处理和解读。

我进行生物信息学分析,请问,用什么好

1、在网上NCBI数据库里进行比对，选择blast，然后在选择核苷酸比对，就知道这些序列是什么了。

2、分子进化与系统发育 学习分子进化与系统发育的入门教材；做进化分析的首要必读书，俗称绿宝书的也是这本。如果你学习分子进化，可以收藏一下。

3、结构生物信息学分析 利用蛋白质结构数据库（例如PDB）获取或预测蛋白质的三维结构。通过分子动力学模拟，来理解蛋白质的运动学特性和结构稳定性。进行结构比对，理解蛋白质家族内的结构相似性和差异。功能预测和注释 预测蛋白质的功能区域（例如活性位点、配体结合位点等）。

4、去NCBI上进行Blast，如果与已知的基因相同，可以直接点开它的基因简介，一般都会有该基因的结构功能说明。

5、用序列对比、进化树一类的生物信息学软件解决一个生物学问题，我至今没想好什么生物学问题，希望大伙，生物学方面的专家帮下忙。越快越好，3天之内能解决的，追加50分。大家踊跃回答哈... 用序列对比、进化树一类的生物信息学软件解决一个生物学问题，我至今没想好什么生物学问题，希望大伙，生物学方面的专家帮下忙。

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