定量蛋白质组价格-蛋白质定量法

蛋白质工程 39

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蛋白质组简介

1、蛋白质组学是一门专注于动态探索基因调控机制的学科,其核心任务是对基因表达所对应的蛋白质水平进行定量测量。它旨在揭示疾病、药物如何影响生命过程,以及解析基因表达调控的深层次原理。蛋白质组研究并非全新的领域,而是已有20多年历史的蛋白质谱和基因产物图谱技术的深化和拓展。

2、蛋白质组,又译作蛋白质体,原文为Proteome,这个字最早出现的时间是1995年,渐渐应用到不同生物系统的研究中。蛋白质体是指组织或细胞中所有的蛋白质。

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(图片来源网络,侵删)

3、蛋白质组指的是由一个基因组,或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。这个概念最初是由Marc Wilkins提出的,是蛋白质与基因组两个词的组合。蛋白质组与基因组的概念有所不同,它并不是固定不变的,而是随着组织、甚至环境状态的不同而改变。

4、蛋白质组(Proteome)一词,源于蛋白质(protein)与 基因组(genome)两个词的组合,意指“一种基因组所表达的全套蛋白质”,即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。

5、蛋白质组的概念最早由Marc Wilkins提出,是指由一个基因组或一个细胞、组织中表达的所有蛋白质的***。这一概念与基因组的概念有着显著的区别,它不仅受基因调控,还受到组织类型和环境状态的影响。蛋白质组的概念之所以重要,是因为它超越了简单的基因-蛋白质关系,揭示了生物体复杂的功能网络。

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6、蛋白质组学是研究生物体内所有蛋白质的组成、结构、功能及其相互关系的学科。它通过大规模的蛋白质分析方法,探索蛋白质在细胞、组织乃至整个生物体中的表达模式,揭示蛋白质在生理、病理过程中的作用机理。蛋白质组学的兴起,极大地推动了生命科学、医学、农业等多个领域的研究。

定量蛋白质组学技术发展

1、自上世纪70年代以来,质谱技术在定向蛋白质组学领域的应用已经历了显著的发展。那时,三重四极杆质谱仪的出现开启了这一研究的新篇章,80年代的研究文献首次展示了它在检测肽段方面的潜力。近年来,定向质谱技术的应用范围得到了前所未有的扩展。

2、靶向定量蛋白质组学技术,利用质谱仪特性,对离子进行多次筛选,靶向选定目标蛋白多肽的碎裂离子,进行定向检测。目前主要发展为两种技术:MRM(多反应监测)和PRM(平行反应监测)。MRM技术使用三重四级杆质谱技术的定性多重离子筛选能力,对复杂样品中多个特定蛋白/肽段/小分子进行靶向定量分析。

3、随着质谱硬件性能的提升和新扫描方式的发展,非标记定量技术在检测深度和定量准确性方面已接近或达到与标记定量相当的水平,成为定量蛋白质组学研究的首选方法。对于磷酸化蛋白质组学研究,磷酸化肽段富集技术是关键步骤。

4、在未来的发展中,蛋白质组学的研究领域将更加广泛。在应用研究方面,蛋白质组学将成为寻找疾病分子标记和药物靶标最有效的方法之一。

5、然而,随着技术的进步,是否能开发出更精准、微量的技术来支持蛋白质组学的发展呢?答案显然是否定的。联川生物基于Proximity Extension Assay (PEA)技术,为蛋白质组学提供了强有力的服务。PEA技术,以其高通量、高特异性、高灵敏度和宽广的动态范围,为靶向蛋白质组定量分析提供了独特的优势。

多组学高分文献14-乳腺癌定量蛋白质组学和蛋白质组学前景

高通量蛋白质定量技术的并行发展已使基于乳腺肿瘤的蛋白质分子表征迅速发展,2019年4月发表在《Nature Communications》的一项研究中,通过对来自5种乳腺癌亚型的共45个肿瘤样本进行基因组、转录组和蛋白质组检测,在PAM50分型的基础上展开研究并对乳腺癌分子分型进行了概述。

最高影响因子:3373。该文章题为《揭示三阴性乳腺癌铁死亡异质性,为LAR亚型精准治疗开辟新路径》,发表于《Cell Metaboli***》。主要研究领域:代谢组学、蛋白质组学和多组学。BIOTREE在这些领域展现了卓越的贡献。

对95个***内膜癌进行了全面的蛋白质组学表征,包括83个***内膜样癌和12个浆液性肿瘤。这项分析揭示了扰动对p53和Wnt /β-catenin途径的可能新结果,确定了circRNA在上皮-间质转化中的潜在作用,并提供了有关临床和基因组肿瘤亚组的蛋白质组学标志物的新信息,包括与已知的关系可药物化途径。

蛋白质组学虽然问世时间很短,但已经在研究细胞的增殖、分化、异常转化、肿瘤形成等方面进行了有力的探索,涉及到白血病、乳腺癌、结肠癌、膀胱癌、前列腺癌、肺癌、肾癌和神经母细胞瘤等,鉴定了一批肿瘤相关蛋白,为肿瘤的早期诊断、药靶的发现、疗效判断和预后提供了重要依据。

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