r语言与生物信息学-r语言与生物信息学应用
文章信息一览：
R语言入门(经典)
1、语言入门报告内容一R简介二函数与对象三编写脚本四R绘图五编写函数六数据保存一R简介R语言的由来R语言是从S语言演变而来的。S语言是二十世纪70年代诞生于贝尔实验室，由RickBecker，JohnChambers，AllanWilks开发。
2、而match（C，B）的结果就很不一样了，它的返回结果同样与前面的向量等长，但是它并非返回逻辑向量，而是遍历了C里面的一个个元素，判断它们是否在B中出现过，如果出现就返回在B中的索引号，如果没有出现，就返回NA。
3、掌握R语言的索引，最基本操作为 写出对象名字，并在随后中括号里写出对应的索引即可 。若对象是一维的，如向量，只需要提供一个位置索引；若对象是二维的，如数据框，则提供两个位置索引，中间用逗号隔开。n维则用n个索引。另外数据框和列表还可用 $ 来索引。
4、李东风r语言教程是一份面向初学者的r语言学习教材，该教程共分为五个部分，包括入门篇、数据分析篇、数据清洗篇、数据可视化篇和高级应用篇，每个部分包含多个章节。在入门篇中，教程介绍了r语言的基本语法和常用数据结构，如向量、矩阵和数据框等。
5、本系列课程要求大家有一定的R语言基础，对于完全零基础的同学，建议去听一下师兄的《生信必备技巧之——R语言基础教程》。本课程将从最基本的绘图开始讲解，深入浅出的带大家理解和运用强大而灵活的ggplot2包。内容包括如何利用ggplot2绘制散点图、线图、柱状图、添加注解、修改坐标轴和图例等。
6、统计建模与R软件（薛毅著）：非常优秀的R语言入门教材，涵盖了所有R的基础应用&方法，示例代码也很优秀。作为一本中文的程序语言教材，绝对是最优秀的之一。但是要看懂这本书，还是需要“已经了解些高级程序语言”。PS：我亲爱的吉林大学图书馆，有两本该教材流通，我常年霸占一本。
R语言中有哪些包可以处理批次效应
1、可以用sva包处理，R sva包去除批次效应（batch effect）标签：batch-effectr生物信息学 前言：sva包可以去除高通量实验中的批次效应和其它一些无关变量带来的影响。
2、Seurat是一种R包，设计用于QC，分析和探索单细胞RNA-seq数据。 Seurat旨在使用户能够从单细胞转录组测量中识别和解释异质性来源，并整合不同类型的单细胞数据。
3、核心包是R语言自带的包，包含了许多常用的函数和数据结构，可以直接调用使用。例如，ggplotdplyr、tidyr等都是常用的核心包。用户自定义包是由用户自己编写的包，包含一些特定的函数和数据结构，可以用于解决特定的问题。
生物信息学入门需要具备什么能力?
时间管理和组织能力：学习生物信息学需要处理大量的信息和任务，有效的时间管理和组织能力可以帮助你更高效地学习和工作。总之，学好生物信息学专业需要多方面的努力，包括扎实的生物学基础、强大的计算机技能、统计学知识、实践操作能力、持续的学习和自我提升，以及良好的交流和合作能力。
生物信息学是一门交叉学科，它结合了生物学、计算机科学和信息技术。要想学好生物信息学，需要掌握一定的基础知识，如生物学、计算机科学和数学等。此外，还需要具备一定的实践能力，如编程、数据分析和实验设计等。
如果做数据库或者server，推荐再学PHP，MySQL，JavaScript 课程 Bioinformatics： 生物信息导论和方法（北大高歌老师的课程，讲解逻辑清晰，由浅入深），MOOC。
关于r语言与生物信息学，以及r语言与生物信息学应用的相关信息分享结束，感谢你的耐心阅读，希望对你有所帮助。
