蛋白质组学分析蛋白修饰-蛋白质组学方法

蛋白质工程 32

今天给大家分享蛋白质组学分析蛋白修饰,其中也会对蛋白质组学方法的内容是什么进行解释。

文章信息一览:

常见组蛋白修饰

这是因为这种组蛋白修饰更常见于与发育和建立细胞身份有关的DNA区域。 H3K4me3是常用的组蛋白修饰。 H3K4me3是最不丰富的组蛋白修饰之一。 然而,它在转录起始位点(TSS)附近的活性启动子上高度富集, 与转录呈正相关 。

主要有甲基化,乙酰化,磷酸化等。一般甲基化与染色体的失活有关。乙酰化一般代表染色质的活性状态,有的组蛋白要先去甲基化,再乙酰化活化。磷酸化(如H1的)一般与细胞周期的状态有关,不能磷酸化,染色体不能进行。

蛋白质组学分析蛋白修饰-蛋白质组学方法
(图片来源网络,侵删)

组蛋白的甲基化修饰:组蛋白被甲基化的位点是赖氨酸和精氨酸. 赖氨酸可以分别被三甲基化,精氨酸只能被二甲基化.在组蛋白H3上,共有5个赖氨酸位点可以被甲基化修饰.一般来说,组蛋白H3K4的甲基化主要聚集在活跃转录的启动子区域。组蛋白H3K9的甲基化同基因的转录抑制及异染色质有关。

组蛋白的修饰有哪些?作用是什么?

组蛋白的修饰作用包括甲基化、乙酰化、磷酸化及ADP核糖基化等。(3)组蛋白修饰意义:一般来说,组蛋白乙酰化能选择性的使某些染色质区域的结构从紧密变得松散,开放某些基因的转录,增强其表达水平。而组蛋白甲基化既可抑制也可增强基因表达。乙酰化修饰和甲基化修饰往往是相互排斥的。

HH4修饰作用较普遍,H2B有乙酰化作用、H1有磷酸化作用。组蛋白修饰的生物学意义:一是改变染色体的结构,直接影响转录活性;二是核小体表面发生改变,使其他调控蛋白易于和染色质相互接触,从而间接影响转录活性。

蛋白质组学分析蛋白修饰-蛋白质组学方法
(图片来源网络,侵删)

组蛋白修饰是指在组成核小体的组蛋白末端所发生的甲基化、乙酰化、磷酸化和泛素化等修饰。这些修饰可以标记不同的染色质结构域并影响DNA代谢相关的过程。例如,H3K9me3和H3K27me3等修饰可以抑制基因转录,而H3K4me3和H3K36me3等修饰则可以促进基因转录。

组蛋白修饰通常包括乙酰化、甲基化、泛素化、磷酸化等,这些化学修饰的加入或移除通常是由一系列特定的酶来调控的:组蛋白乙酰转移酶(HATs):负责组蛋白的乙酰化,通常与基因激活有关。组蛋白去乙酰化酶(HDACs):移除组蛋白的乙酰基团,通常与基因抑制有关。

组蛋白修饰及其功能表观遗传学(epigentics)是研究不改变DNA序列而由于其外部修饰引起的基因开放与否的学科,涉及的主要机制有DNA甲基化、组蛋白修饰、基因印记、RNA干扰等。其中研究得最多是DNA甲基化和组蛋白乙酰化、组蛋白甲基化,这些修饰与活化或失活染色质的结构形成相关。

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