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生物信息 11个月前 (05-21) 108

本篇文章给大家分享蓝图生物信息，以及蓝图有限公司对应的知识点，希望对各位有所帮助。

文章信息一览：

1、基因蓝图对人类处于什么作用
2、解读生命的密码—DNA
3、基因组装的概念/算法(OLC,K-mer)详解
4、基因组,转录组,蛋白组有什么区别,相互关系是咋样的?

基因蓝图对人类处于什么作用

1、基因蓝图对人类处于什么作用基因（遗传因子）是具有遗传效应的DNA片段。基因支持着生命的基本构造和性能。储存着生命的种族、血型、孕育、生长、凋亡过程的全部信息。环境和遗传的互相依赖，演绎着生命的繁衍、细胞分裂和蛋白质合成等重要生理过程。

2、这次的DNA蓝图被破译，对于我们普通人的生活影响主要就是在医疗和长寿方面。因为我们每个人身上的DNA都蕴含了我们体内全部的信息，包括生病、长寿等。

（图片来源网络，侵删）

3、年3月，法国一个科学家小组发表了一个全面的基因图谱，该图谱能够对开发许多病症（从学习低能到精神分裂症）的诊断试剂和治疗方法作出贡献。

4、至少可以让我们了解人体的各种运作指令，它还将使癌症和抑郁症等各种疾病的发现、预防和治疗发生革命性的变化，甚至还有可能帮助我们克服衰老。可能会破坏个人隐私并在保险和就业等问题上导致“基因歧视”的出现。使生物技术行业重新焕发青春。

5、而且所能破译的也只是群体的共性，不可能投入巨资对每个人进行“个性”的完全测定。一些社会和人文学家则担心人类会扭曲地利用基因技术。如为达到培育完美后代的目的，进行婴儿改造，导致堕胎率大幅度上升；身体有缺陷的残疾人将有可能在就业、保险和医疗等方面遭受更多的歧视；等等。

（图片来源网络，侵删）

解读生命的密码—DNA

1、在无尽的宇宙中，生命的演化历程如同一部宏大的史诗。数百万年的生物进化树，犹如星球间的星际联系，揭示着生命的起源与变迁。DNA，这个神秘的遗传密码，是这演化历程中的核心线索，将地球生命史镌刻在每一个生物细胞内。

2、DNA生命密码是指人体细胞中的遗传物质，它具有储存基因信息的作用。DNA分为四种不同的碱基，通过这些碱基的组合，能够形成不同的基因序列，进而决定个体的生长发育、特征和遗传信息。这些基因组成了一个个生命密码，掌握这些密码的科学家和医生能够为我们的生活带来很多好处。DNA对生命的重要性不言而喻。

3、DNA：生命密码的构筑者/ DNA，全称为脱氧核糖核酸，是生命的遗传物质，其构造独特而精密。构成DNA的基本元素包括碳（C）、氢（H）、氧（O）、氮（N）和磷（P）。

4、在DNA“绳梯”一条链上3个相邻的碱基就可组成1个密码子，这密码子就是基因。它们控制了天然蛋白质中20种氨基酸的形成，这些氨基酸是构成生命的物质基础。如果说AT、TA、GC、CG在DNA的语言中相当4个字母，那么这20种氨基酸可以说相当于20个字。

基因组装的概念/算法(OLC,K-mer)详解

由于二代测序得到的reads长度较短，包含的信息量较少，因此完成基因组拼接需要较高的覆盖度。OLC算法适用于读长较长的序列组装，通过构成的OLC图寻找Consensus sequence的过程，实际上是哈密顿通路寻找的问题。若***用OLC算法，会增加组装的复杂性以及运算量。

总结）即k-mer表示将reads划分为多少个长度为k的短片段，如设置k=39，即k-mer为39-mer，一条150bp的read，共产生150-39+1=112个长度为39的短片段 k-mer选择对基因组组装的影响 k-mer大小的选择对基因组组装有多种影响。这种影响在较大和较小的k-mers之间差异大。

简单来说这种算法就是将所有的reads拿出来，相互比对，找到重叠的reads，然后构建长的连续的contigs，最后再将contigs组在一起形成scaffolds。

把测序得到的reads通过截取k-mer后用于分析。比如评估基因组特征，组装基因组，物种样品污染评估等。评估基因组特征（genome survey）包括评估基因组大小（size），杂合度，重复序列比例等。k-mer分析分为 k-mer频数统计和基因组特征评估两步。此外，Smudgeplot还可以用k-mer分析评估物种的倍性。

序列组装算法可以被分为两种类型，即重叠图算法和 de Bruijn 图算法。重叠图算法利用碎片化和序列重叠来确定序列之间的关联性，而 de Bruijn 图算法则***用了滑动窗口和 K-mer 分解技术将原始序列进行拆分，再进行组装。