首页生物信息正文

生物信息的工具-生物信息的工具是什么

生物信息 8个月前 (04-26) 75

本篇文章给大家分享生物信息的工具，以及生物信息的工具是什么对应的知识点，希望对各位有所帮助。

文章信息一览：

丁香园（生信板块）：国内知名论坛，医学生必去之地。小木虫：资源丰富，国内另一个重量级论坛。生物统计家园：有待你探索的统计领域宝藏。基因堂：聚焦基因科学，扩展你的知识视野。

基因组数据库：这些数据库存储了各种生物体的基因组序列信息，包括DNA序列、RNA序列和蛋白质序列等。这些数据库的特点是数据量大、复杂度高，需要使用专业的生物信息学工具进行分析和解释。

（图片来源网络，侵删）

PLOB/——生物信息学知识库，汇集了基础到专业的资料，是学习者的知识宝库。http：//陈连福博客/——连福老师的培训教材和在线资源，尽管网站已停更，但其专业度不容忽视。

Uniprot：全蛋白库。NCBI和EBI的蛋白库来源于此。目前包括两部分：SwissProt是人工校对过的，TrEMBL是自动校对的。Pfam：蛋白家族库。可以使用配套的HMMER进行搜索。比BLAST能找到更远缘的东西，而且找到的东西是结构域。

下面将分别介绍这三个最大的数据库以及其他的生物信息学数据资源。1．NCBI简介 NCBI-Genome Database：存储了目前绝大多数的被测序出来的基因组，目前有1000+基因组被测序出来。

（图片来源网络，侵删）

生物信息学应用：生物信息学在医学、农业、生物技术等领域都有广泛的应用，如医学诊断、新药研发、作物育种等。

例如，Reverse Complement工具，让你的序列操作如丝般流畅； Primer3Plus-引物设计，一键生成高质量引物，省去设计的繁琐；而IUPAC碱基和氨基酸缩写查询，帮你解码那些看起来陌生的符号，让研究语言变得通俗易懂。

小木虫：资源丰富，国内另一个重量级论坛。生物统计家园：有待你探索的统计领域宝藏。基因堂：聚焦基因科学，扩展你的知识视野。biostars：问题与答案的交流平台，提升实战能力。

一般来说所用的分析工具有在线跟下载的下面简要列举一些常用在线软件的使用使用VecScreen工具，分析下列未知序列，输出序列长度、载体序列的区域、可能使用的克隆载体都有哪些。

BioPerl、BioPython：Perl和Python的生物学模块。R：类似matlab的语言，有一大堆的生物学包。SOAP：华大基因搞的高通量测序工具包，有de-novo拼接的，有mapping的，还有一些后续分析的。bowtie：一个用于序列mapping的软件。

许多数据库都可以通过检索工具SRS 査询。

DDBJ（DNA Data Bank of Japan）：DDBJ是日本的国家生物信息学中心，成立于1986年。DDBJ的主要职责是收集、存储、分析和发布日本的生物数据，包括DNA序列、蛋白质序列、基因组数据等。

我原来常用的：NCBI：持有INSDC的节点。网站上有核酸、蛋白、基因名、基因组名等等的搜索工具，以及BLAST序列比对搜索工具，PUBMED文献数据库，Taxonomy数据，COG蛋白家族库等等。

EndNote X9：一个专门用于管理参考文献数据库的软件，有了它，再也不用手动给参考文献编号。 DNAMAN 9：一款高度集成化的分子生物学应用软件。主要功能包括多重序列对比、PCR引物设计、蛋白质分析、质粒绘图等功能。

关于生物信息的工具和生物信息的工具是什么的介绍到此就结束了，感谢你花时间阅读本站内容，更多关于生物信息的工具是什么、生物信息的工具的信息别忘了在本站搜索。